Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RAB3IPQ96QF0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms