Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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SAMD8Q96LT4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SAMD8Q96LT4 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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