Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SEMA4DQ92854 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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