Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH3Q8TBE1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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