Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HECW1Q76N89 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HECW1Q76N89 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms