Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF7IPQ6VMQ6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATF7IPQ6VMQ6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF7IPQ6VMQ6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF7IPQ6VMQ6 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF7IPQ6VMQ6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF7IPQ6VMQ6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF7IPQ6VMQ6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF7IPQ6VMQ6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATF7IPQ6VMQ6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATF7IPQ6VMQ6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms