Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CTF1Q16619 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTF1Q16619 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms