Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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VAMP3Q15836 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NCOR2-201ENST00000356219 7226 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
VAMP3Q15836 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
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