Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TAF1AQ15573 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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