Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
RUNX3Q13761 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RUNX3Q13761 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms