Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CDH18Q13634 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDH18Q13634 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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