Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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ITGB3BPQ13352 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGB3BPQ13352 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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