Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TUBB4BP68371 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms