Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CABP4P57796 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABP4P57796 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABP4P57796 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABP4P57796 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CABP4P57796 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABP4P57796 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABP4P57796 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABP4P57796 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CABP4P57796 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABP4P57796 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CABP4P57796 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CABP4P57796 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CABP4P57796 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CABP4P57796 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms