Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PTDSS1P48651 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms