Protein–RNA interactions for Protein: P30040

ERP29, Endoplasmic reticulum resident protein 29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP29P30040 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ERP29P30040 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ERP29P30040 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ERP29P30040 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP29P30040 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP29P30040 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP29P30040 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP29P30040 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP29P30040 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP29P30040 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP29P30040 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ERP29P30040 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms