Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
HOXA5P20719 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms