Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATG7O95352 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ATG7O95352 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ATG7O95352 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG7O95352 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG7O95352 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG7O95352 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ATG7O95352 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ATG7O95352 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms