Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TRAK2O60296 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TRAK2O60296 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms