Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GOLGA6L3A6NEY3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms