Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRBV2A0A0J9YWF9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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TRBV2A0A0J9YWF9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRBV2A0A0J9YWF9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRBV2A0A0J9YWF9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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TRBV2A0A0J9YWF9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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