Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PDP1Q9P0J1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms