Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP13A2Q9NQ11 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms