Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SHANK2-AS3Q9BTD1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SHANK2-AS3Q9BTD1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SHANK2-AS3Q9BTD1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SHANK2-AS3Q9BTD1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SHANK2-AS3Q9BTD1 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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