Protein–RNA interactions for Protein: Q96HS1

PGAM5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5Q96HS1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PGAM5Q96HS1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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