Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHMP1BQ7LBR1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms