Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
AP3B2Q13367 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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AP3B2Q13367 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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AP3B2Q13367 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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AP3B2Q13367 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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AP3B2Q13367 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
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