Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC5Q00444 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXC5Q00444 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms