Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMF1P82094 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMF1P82094 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMF1P82094 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMF1P82094 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMF1P82094 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMF1P82094 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMF1P82094 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMF1P82094 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMF1P82094 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMF1P82094 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMF1P82094 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMF1P82094 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMF1P82094 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMF1P82094 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMF1P82094 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms