Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GBX2P52951 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GBX2P52951 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
GBX2P52951 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms