Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSHP51688 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSHP51688 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSHP51688 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSHP51688 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSHP51688 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSHP51688 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SGSHP51688 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SGSHP51688 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SGSHP51688 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSHP51688 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSHP51688 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSHP51688 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSHP51688 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSHP51688 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSHP51688 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSHP51688 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SGSHP51688 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SGSHP51688 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSHP51688 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSHP51688 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSHP51688 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSHP51688 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSHP51688 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSHP51688 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SGSHP51688 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms