Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FNTAP49354 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FNTAP49354 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FNTAP49354 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms