Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CRABP1P29762 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms