Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
V9GY48 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
V9GY48 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
V9GY48 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
V9GY48 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
V9GY48 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
V9GY48 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
V9GY48 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
V9GY48 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
V9GY48 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
V9GY48 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
V9GY48 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
V9GY48 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
V9GY48 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
V9GY48 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
V9GY48 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
V9GY48 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
V9GY48 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
V9GY48 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
V9GY48 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
V9GY48 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
V9GY48 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
V9GY48 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
V9GY48 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
V9GY48 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
V9GY48 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
V9GY48 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
V9GY48 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
V9GY48 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
V9GY48 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
V9GY48 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
V9GY48 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
V9GY48 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
V9GY48 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
V9GY48 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
V9GY48 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
V9GY48 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
V9GY48 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
V9GY48 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
V9GY48 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
V9GY48 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
V9GY48 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
V9GY48 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
V9GY48 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
V9GY48 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
V9GY48 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
V9GY48 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
V9GY48 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
V9GY48 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
V9GY48 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
V9GY48 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
V9GY48 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
V9GY48 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
V9GY48 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
V9GY48 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
V9GY48 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
V9GY48 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
V9GY48 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
V9GY48 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
V9GY48 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
V9GY48 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
V9GY48 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
V9GY48 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
V9GY48 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GY48 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GY48 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GY48 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GY48 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GY48 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GY48 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
V9GY48 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
V9GY48 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
V9GY48 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
V9GY48 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
V9GY48 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
V9GY48 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
V9GY48 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
V9GY48 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
V9GY48 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
V9GY48 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
V9GY48 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
V9GY48 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
V9GY48 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
V9GY48 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
V9GY48 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
V9GY48 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
V9GY48 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
V9GY48 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
V9GY48 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
V9GY48 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
V9GY48 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
V9GY48 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
V9GY48 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
V9GY48 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
V9GY48 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
V9GY48 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
V9GY48 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
V9GY48 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
V9GY48 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
V9GY48 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms