Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SETBP1Q9Y6X0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SETBP1Q9Y6X0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
SETBP1Q9Y6X0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SETBP1Q9Y6X0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SETBP1Q9Y6X0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
SETBP1Q9Y6X0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
SETBP1Q9Y6X0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETBP1Q9Y6X0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETBP1Q9Y6X0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETBP1Q9Y6X0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
SETBP1Q9Y6X0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SETBP1Q9Y6X0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SETBP1Q9Y6X0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.8 ms