Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP3Q9Y6F1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP3Q9Y6F1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PARP3Q9Y6F1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PARP3Q9Y6F1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PARP3Q9Y6F1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PARP3Q9Y6F1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PARP3Q9Y6F1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PARP3Q9Y6F1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PARP3Q9Y6F1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP3Q9Y6F1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP3Q9Y6F1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP3Q9Y6F1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
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