Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RAD54BQ9Y620 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RAD54BQ9Y620 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAD54BQ9Y620 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAD54BQ9Y620 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms