Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN16Q9Y5I7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN16Q9Y5I7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN16Q9Y5I7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms