Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.53■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
R3HCC1Q9Y3T6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
R3HCC1Q9Y3T6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
R3HCC1Q9Y3T6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
R3HCC1Q9Y3T6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms