Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C5

RNF11, RING finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF11Q9Y3C5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF11Q9Y3C5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RNF11Q9Y3C5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RNF11Q9Y3C5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF11Q9Y3C5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF11Q9Y3C5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RNF11Q9Y3C5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms