Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
TRAPPC8Q9Y2L5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
TRAPPC8Q9Y2L5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.25■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TRAPPC8Q9Y2L5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
TRAPPC8Q9Y2L5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms