Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I7

PIKFYVE, 1-phosphatidylinositol 3-phosphate 5-kinase, humanhuman

Predictions only

Length 2,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIKFYVEQ9Y2I7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PIKFYVEQ9Y2I7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PIKFYVEQ9Y2I7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PIKFYVEQ9Y2I7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PIKFYVEQ9Y2I7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms