Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2A7

NCKAP1, Nck-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1Q9Y2A7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NCKAP1Q9Y2A7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NCKAP1Q9Y2A7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NCKAP1Q9Y2A7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms