Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERGIC3Q9Y282 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERGIC3Q9Y282 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERGIC3Q9Y282 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms