Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APOBEC2Q9Y235 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
APOBEC2Q9Y235 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
APOBEC2Q9Y235 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
APOBEC2Q9Y235 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms