Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV7

PHF24, PHD finger protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF24Q9UPV7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF24Q9UPV7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF24Q9UPV7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PHF24Q9UPV7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PHF24Q9UPV7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PHF24Q9UPV7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms