Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULW8

PADI3, Protein-arginine deiminase type-3, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI3Q9ULW8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PADI3Q9ULW8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PADI3Q9ULW8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PADI3Q9ULW8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.4 ms