Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM6

CNOT6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT6Q9ULM6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNOT6Q9ULM6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT6Q9ULM6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT6Q9ULM6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms