Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TSKSQ9UJT2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TSKSQ9UJT2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TSKSQ9UJT2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TSKSQ9UJT2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms