Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TUBD1Q9UJT1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TUBD1Q9UJT1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TUBD1Q9UJT1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms